Centre québécois de données génomiques (CQDG)

FerLab a reçu le mandat de construire le Centre québécois de données génomiques, une infrastructure de données qui hébergera les grands jeux de données génomiques générés par des projets cliniques et de recherche du Québec.

Plusieurs pétaoctets de données génomiques seront ainsi mis à la disposition des chercheurs du monde entier grâce à un portail web de données et une plateforme infonuagique d’analyse.

Secure Data For Health (SD4H)

En collaboration avec l’Université McGill, l'Université Laval et l’Université de Sherbrooke, FerLab a obtenu une subvention de 20 millions $ pour construire une infrastructure infonuagique hautement sécuritaire qui servira à stocker et analyser les données sensibles en santé (clinique et génomique). 

Ce nouvel infonuage, déployé chez Calcul Québec, comprendra plus de 7000 CPUs, 160 GPUs et 20 pétaoctets d’espace de stockage. L’infrastructure servira notamment à héberger la plateforme du Centre québécois de données génomiques (Voir plus haut).

Centre québécois de génomique clinique

Le centre québécois de génomique clinique (CQGC)

Les systèmes de santé intègrent de plus en plus l'analyse de l'ADN comme examen de routine pour le diagnostic et le traitement des patients.

Dans cette optique, FerLab a pour mandat de construire la plateforme bio-informatique du nouveau Centre québécois de génomique clinique qui séquencera les exomes et les génomes des patients pour le compte du ministère de la Santé du Québec.

La plateforme, en cours de développement, sera utilisée par les médecins et les généticiens pour prescrire des tests génétiques aux patients québécois et analyser les résultats.

UniC

Au Québec, les données dans le secteur hospitalier sont difficilement accessibles en raison de la diversité des systèmes informatiques existants, de la complexité du processus d’extraction et de l’hétérogénéité des données. 

C’est pourquoi le CHU Sainte-Justine a mandaté FerLab pour la mise en place d’un lac de données afin de centraliser un volume important de données cliniques et administratives provenant des différents systèmes d'information hospitaliers et de les rendre accessibles pour la recherche.

L’UniC est donc un projet de plateforme institutionnelle de grande envergure dont l’objectif est de tirer profit des données hospitalières massives et de l’intelligence artificielle au service de la santé des mères et des enfants.

Kids First

Cet important programme de recherche du National Institute of Health (NIH) des États-Unis vise à améliorer les connaissances sur la biologie du cancer infantile et des malformations congénitales structurelles.

À cet effet, une collaboration stratégique a été mise en place pour permettre le partage de jeux de données cliniques et génomiques sur ces conditions provenant d’études menées générés aux Etats-Unis.

FerLab et ses collaborateurs au Children’s Hospital of Philadelphia a orchestré la mise en place d’un portail intégrant les données de 30 études totalisant plus de 26,000 participants et leurs données omiques.

Rendez-vous ici pour en connaître davantage.

INCLUDE Data Coordinating Center

INCLUDE est un projet novateur financé par le National Institute of Health (NIH) qui réunit plusieurs partenaires dans le but d'accélérer les découvertes entourant la santé et la qualité de vie des personnes atteintes du Syndrome de Down (Trisomie 21).

Afin d’atteindre cet objectif, FerLab, et les partenaires de ce projet développent la première plateforme de données au monde conçue spécifiquement pour faire avancer les connaissances dans ce domaine.

Cette plateforme offrira un accès intégré aux données et des outils d’exploration et de visualisation des données pour faciliter la réalisation d’études novatrices sur l'étiologie des comorbidités observées plus fréquemment dans cette population.